Google DeepMind prezentuje SynthID Bio do znakowania białek projektowanych przez sztuczną inteligencję

Według trzech źródeł wtórnych Google DeepMind ogłosiło 30 września 2026 r. SynthID Bio — zestaw metod znakowania sekwencji projektowanych przez sztuczną inteligencję białek oraz przewidywanych struktur 3D. Opisywane testy wykazały wysoką wykrywalność znaków w określonych zbiorach, ale pokazały też, że część manipulacji może je usunąć.

System ma znakować sekwencje podczas próbkowania w ProteinMPNN. Metoda statystycznie zmienia prawdopodobieństwo wyboru aminokwasów. Drugą część systemu stanowi znakowanie struktur przewidywanych przez AlphaFold 3. Zespół miał dostroić część modelu tak, aby w przewidywanej strukturze powstawał wykrywalny wzorzec geometryczny.

Według Binary Verse AI i NeoTeo znakowanie struktur osiągnęło ponad 99,8 proc. wyników prawdziwie dodatnich przy 0,1 proc. wyników fałszywie dodatnich. Wynik ten dotyczył określonego zbioru ewaluacyjnego AlphaFold 3. Materiały nie podają jego liczebności ani pełnego składu. W przypadku filtrowanych projektów sekwencyjnych źródła opisały 100 proc. TPR przy 0,1 proc. FPR i skalibrowanym progu. Nie oznacza to, że system wykrywa wszystkie możliwe oznakowane sekwencje.

Testy funkcjonalne obejmowały bindery skierowane przeciwko VEGF-A, SC2RBD, czyli domenie wiążącej receptor białka kolca SARS-CoV-2, oraz PD-L1. NeoTeo podało, że badacze wykorzystali 15 wcześniej zaprojektowanych szkieletów dla każdego celu. W wybranych warunkach pomiaru, między innymi z użyciem SPR, nie wykazano istotnej różnicy w określonych miarach powinowactwa. Przy innym progu powinowactwa jedna z grup binderów bez znakowania osiągała wyższy odsetek trafień.

Źródła opisały także ograniczenia systemu. Znak sekwencyjny można było usunąć przez ponowne próbkowanie w ProteinMPNN. Znak strukturalny usuwała testowana relaksacja molekularna z użyciem OpenMM i pola siłowego Amber99sb. W opisywanych warunkach znak przetrwał natomiast określony poziom szumu współrzędnych oraz transformacje geometryczne.

SynthID Bio ma pomagać w ustalaniu pochodzenia projektów biologicznych, między innymi podczas screeningu zamówień DNA i oznaczania syntetycznych danych w bazach biologicznych. Znak wodny nie jest certyfikatem bezpieczeństwa biologicznego. Nie dowodzi, że białko jest bezpieczne, nietoksyczne lub niepatogenne, a jego brak nie świadczy o zagrożeniu. Wcześniejsza metoda FoldMark, opublikowana w 2025 r., wskazuje, że rozwiązanie Google DeepMind rozwija istniejący kierunek badań.

Nie potwierdzono istnienia recenzowanego artykułu w „Nature”, publicznego repozytorium ani operacyjnego wdrożenia systemu przez firmy zajmujące się syntezą DNA. Dalszej weryfikacji wymagają także niezależna replikacja, dane testowe oraz skuteczność metod w szerszej klasie białek.