Mycopathologia
2026-04-10
Pojawienie się i profilowanie genomowe wielolekoopornych szczepów Candida auris izolowanych od pacjentów OIT w malezyjskim szpitalu klinicznym
Emergence and Genomic Profiling of Multidrug-Resistant Candida auris Isolated from Intensive Care Unit Patients in a Malaysian Teaching Hospital.
Recenzja AI
Cel badania
Celem badania było opisanie pierwszych przypadków zakażeń Candida auris w malezyjskim szpitalu uniwersyteckim oraz ocena ich oporności na leki przeciwgrzybicze i tła genetycznego.
Metoda
Przeprowadzono retrospektywną analizę przypadków inwazyjnej kandydozy z OIT z lat 2018–2021, identyfikując C. auris metodą MALDI-TOF MS, wykonując testy wrażliwości na leki przeciwgrzybicze oraz sekwencjonowanie całego genomu szczepów.
Wyniki
Cztery szczepy C. auris izolowane z krwi i płynu otrzewnowego były oporne na amfoterycynę B i flukonazol, zachowując wrażliwość na echinokandyny; analiza genomowa wykazała bliskie pokrewieństwo ze szczepami kladu południowoazjatyckiego i obecność mutacji ERG11, CDR1 i ERG2 związanych z opornością.
Znaczenie dla praktyki
Praca podkreśla realne ryzyko zawleczenia i transmisji wielolekoopornych szczepów C. auris w oddziałach intensywnej terapii, co w warunkach polskich wymaga czujności diagnostycznej, ścisłej kontroli zakażeń oraz preferowania echinokandyn w leczeniu podejrzanych lub potwierdzonych zakażeń tym patogenem.
Abstrakt oryginalny
Candida auris, a significant pathogen causing invasive candidiasis with high mortality rates and frequent hospital outbreaks, is understudied in Malaysia. This study retrospectively examined invasive candidiasis cases at Universiti Malaya Medical Centre from 2018 to 2021. Four C. auris strains were isolated from blood and peritoneal samples of intensive care unit patients and identified using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). Antifungal susceptibility testing using Sensititre™ YeastOne YO10 plate showed resistance to amphotericin B (2-4 µg/ml) and fluconazole (256 µg/ml) but susceptibility to echinocandins. Whole-genome sequencing revealed a 12.31 Mb genome, 45.59% G + C content, 99.95-99.99% average nucleotide identity between the isolates, and 190-225 single nucleotide polymorphisms. The Malaysian strains were phylogenetically related to the South Asian Clade (I) and harbored mutations associated with resistance to fluconazole (ERG11 gene: Y132F; CDR1 gene: E709D) and amphotericin B (ERG2 gene: E39D). The first genomic characterization of multidrug-resistant C. auris in Malaysian ICU patients highlights the urgent need for enhanced infection control measures in healthcare settings.